Objetivos

Una parte importante en estadística consiste en comunicar de forma eficiente los resultados obtenidos. En los últimos años se están imponiendo los documentos reproducibles, que permiten incluir, en un mismo documento, tanto el procedimiento estadśitico como los resultados. Así, el análisis es absolutamente diáfano para el lector. Los documentos escritos con knir con R-Markdown son un ejemplo de ello.

El objetivo fundamental de este trabajo es que aprendas a generar este tipo de informes. En este caso se trabaja a partir de los datos de la práctica realizada en Ecología y el documento resultante debe describir cómo se realiza el procesado de los datos y ejecutarlo.

A los profesores de Ecología les tienes que entregar un artículo científico, en el que aparecen las conclusiones del estudio a las que llegas a partir de cierto análisis estadístico. En esa parte del artículo, probablemente tengas que incluir algunas figuras y/o tablas: ajuste de Bonferroni, ordenar de las medias…para respaldar tus conclusiones

Si no estás matriculado este año la asignatura de Ecología (o si piensas no entregar el trabajo de ecología)

Tienes dos opciones:

  1. Trabajar con los mismos datos que quienes están matriculados. En el experimento se consideran 2 especies vegetales distintas y se miden dos variables diferentes: longitud y peso en seco. Para cada especie se miden ambas variables tras aplicar 4 tratamientos:

    • exposición a lixiviados,
    • sombra,
    • sombreado extra por barrera acículas
    • y una combinacion de los 3 anteriores simultaneamente (todos).

    Se considera, además, un grupo de control, al que no se aplica tratamiento alguno. El experimento persigue averiguar si alguno de los tratamientos tiene efecto sobre la variable/especie de estudio (se consideran en total 5 grupos de datos). Aunque el experimento tiene más detalles, a efectos del trabajo de estadística, esto es todo lo que es necesario saber.

  2. Hacer alguno de los trabajos que se proponen para el grado de Biología Sanitaria

Datos

Descarga los datos del experimento de ecología de aquí

Instrucciones y criterios de evaluación

La parte que entregarás en la asignatura de Estadística consiste en un fichero comprimido tal que

Los requisitos que se nombran no tienen porqué completarse en ese orden, es simplemente una sugerencia. En función de las herramientas que decidas usar, puede que

Fecha y modo de entrega

  • Tienes hasta el 10 de Enero para entregar fichero.
  • La entrega se hará a través de la plataforma BlackBoard, subiendo el fichero comprimido.

Observaciones

  • Puede que necesites modificar los ficheros de datos, eliminar manualmente filas y/o colunas que dificultan su lectura desde R (u otro programa).
  • Para simplificar la lectura y procesado de los datos, puede que prefieras generar un fichero .csv para los datos de cada uno de los contrastes ANOVA que vas a realizar.
  • En las diapositivas de ANOVA hay incrustados fragmentos de código para, por ejemplo, hacer de forma autónoma los QQ-plot o comprobar la homocedasticidad
  • Pedro Villar pasará la última media hora de la práctica de la semana del 12 de Diciembre. Resolveremos dudas, él de la parte ecológica, y nosotros de la parte estadística del trabajo

Algunas buenas prácticas son…

  • Antes de nada, decidir qué debe hacer el código. Desglosar el trabajo en pasos sencillos, y programar cada uno de ellos.
  • Guarda cada poco tiempo el fichero.
  • Ejecuta linea a linea el código para tener localizados los posibles errores
  • Es habital trabajar primero sobre un script. Cuando se ha conseguido un código que produce los resultados deseados, trasladarlo al documento reproducible.
  • Dejar las cuestiones estéticas para el final.